Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2CP19387 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR2CP19387 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms