Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FCER1AP12319 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FCER1AP12319 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FCER1AP12319 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms