Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP2P08253 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP2P08253 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP2P08253 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP2P08253 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP2P08253 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP2P08253 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP2P08253 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP2P08253 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP2P08253 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP2P08253 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP2P08253 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP2P08253 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP2P08253 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP2P08253 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP2P08253 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP2P08253 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP2P08253 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP2P08253 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP2P08253 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP2P08253 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP2P08253 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP2P08253 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP2P08253 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP2P08253 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP2P08253 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP2P08253 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP2P08253 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP2P08253 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP2P08253 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP2P08253 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP2P08253 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP2P08253 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP2P08253 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP2P08253 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP2P08253 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP2P08253 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP2P08253 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP2P08253 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP2P08253 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP2P08253 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP2P08253 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP2P08253 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP2P08253 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP2P08253 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP2P08253 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP2P08253 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP2P08253 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP2P08253 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP2P08253 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms