Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTA1P02549 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTA1P02549 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTA1P02549 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPTA1P02549 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTA1P02549 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTA1P02549 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms