Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MT-CO1P00395 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MT-CO1P00395 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MT-CO1P00395 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-CO1P00395 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MT-CO1P00395 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms