Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZBED1O96006 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED1O96006 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED1O96006 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
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