Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BBOX1O75936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BBOX1O75936 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BBOX1O75936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms