Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM4O75871 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM4O75871 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEACAM4O75871 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM4O75871 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms