Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TULP3O75386 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TULP3O75386 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TULP3O75386 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TULP3O75386 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TULP3O75386 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TULP3O75386 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TULP3O75386 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TULP3O75386 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TULP3O75386 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TULP3O75386 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP3O75386 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP3O75386 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP3O75386 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TULP3O75386 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TULP3O75386 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP3O75386 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP3O75386 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP3O75386 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP3O75386 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TULP3O75386 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TULP3O75386 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TULP3O75386 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TULP3O75386 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TULP3O75386 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP3O75386 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP3O75386 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP3O75386 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TULP3O75386 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP3O75386 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP3O75386 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP3O75386 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP3O75386 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP3O75386 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP3O75386 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP3O75386 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP3O75386 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP3O75386 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP3O75386 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP3O75386 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP3O75386 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP3O75386 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP3O75386 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms