Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNCRIPO60506 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNCRIPO60506 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNCRIPO60506 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms