Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LCMT2O60294 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCMT2O60294 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCMT2O60294 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCMT2O60294 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms