Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM8AO60220 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM8AO60220 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM8AO60220 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms