Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC25A20O43772 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC25A20O43772 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A20O43772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms