Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRC1O43663 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRC1O43663 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRC1O43663 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRC1O43663 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRC1O43663 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRC1O43663 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRC1O43663 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRC1O43663 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRC1O43663 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRC1O43663 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRC1O43663 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRC1O43663 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRC1O43663 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRC1O43663 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRC1O43663 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRC1O43663 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRC1O43663 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRC1O43663 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRC1O43663 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRC1O43663 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRC1O43663 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRC1O43663 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRC1O43663 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRC1O43663 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRC1O43663 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRC1O43663 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRC1O43663 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRC1O43663 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRC1O43663 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRC1O43663 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRC1O43663 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRC1O43663 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRC1O43663 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRC1O43663 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRC1O43663 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRC1O43663 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRC1O43663 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRC1O43663 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRC1O43663 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRC1O43663 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRC1O43663 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRC1O43663 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRC1O43663 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRC1O43663 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRC1O43663 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRC1O43663 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRC1O43663 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRC1O43663 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRC1O43663 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRC1O43663 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PRC1O43663 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRC1O43663 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms