Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENRO43583 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DENRO43583 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENRO43583 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENRO43583 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENRO43583 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENRO43583 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DENRO43583 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DENRO43583 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENRO43583 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENRO43583 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENRO43583 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DENRO43583 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DENRO43583 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DENRO43583 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DENRO43583 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DENRO43583 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENRO43583 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENRO43583 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENRO43583 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENRO43583 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DENRO43583 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DENRO43583 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DENRO43583 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENRO43583 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENRO43583 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENRO43583 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENRO43583 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENRO43583 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENRO43583 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENRO43583 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENRO43583 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENRO43583 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENRO43583 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENRO43583 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENRO43583 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms