Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI3O43414 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI3O43414 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI3O43414 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI3O43414 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI3O43414 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI3O43414 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI3O43414 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI3O43414 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI3O43414 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI3O43414 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI3O43414 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI3O43414 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI3O43414 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI3O43414 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI3O43414 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI3O43414 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI3O43414 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI3O43414 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERI3O43414 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERI3O43414 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERI3O43414 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERI3O43414 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERI3O43414 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERI3O43414 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERI3O43414 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERI3O43414 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERI3O43414 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERI3O43414 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms