Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF103O00237 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF103O00237 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF103O00237 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF103O00237 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF103O00237 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF103O00237 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF103O00237 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF103O00237 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF103O00237 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF103O00237 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF103O00237 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF103O00237 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF103O00237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF103O00237 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF103O00237 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF103O00237 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF103O00237 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF103O00237 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF103O00237 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF103O00237 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF103O00237 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF103O00237 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF103O00237 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF103O00237 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF103O00237 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF103O00237 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF103O00237 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF103O00237 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF103O00237 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF103O00237 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF103O00237 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF103O00237 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF103O00237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF103O00237 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF103O00237 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF103O00237 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms