Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms