Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BM21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BM21 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BM21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BM21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BM21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BM21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BM21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BM21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BM21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BM21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BM21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BM21 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BM21 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BM21 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BM21 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BM21 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BM21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BM21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BM21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BM21 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BM21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BM21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BM21 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BM21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BM21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BM21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BM21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BM21 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BM21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BM21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BM21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BM21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BM21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BM21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BM21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BM21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BM21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BM21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BM21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BM21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BM21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BM21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BM21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BM21 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BM21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BM21 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BM21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BM21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BM21 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BM21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms