Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQF6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PQF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PQF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms