Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB11Q9Y547 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSPB11Q9Y547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB11Q9Y547 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms