Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms