Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSR3Q9UNL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSR3Q9UNL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR3Q9UNL2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms