Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TPCN1Q9ULQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPCN1Q9ULQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TPCN1Q9ULQ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
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