Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A1Q9UHI7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC23A1Q9UHI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC23A1Q9UHI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms