Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF4Q9UHB7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF4Q9UHB7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFF4Q9UHB7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFF4Q9UHB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms