Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PEMTQ9UBM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PEMTQ9UBM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms