Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM53CQ9NYF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms