Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARHL2Q9NY43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BARHL2Q9NY43 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARHL2Q9NY43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms