Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO28Q9NVF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO28Q9NVF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FBXO28Q9NVF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXO28Q9NVF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms