Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC42.83■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PDS5BQ9NTI5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PDS5BQ9NTI5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
PDS5BQ9NTI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PDS5BQ9NTI5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms