Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BATF3Q9NR55 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BATF3Q9NR55 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BATF3Q9NR55 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BATF3Q9NR55 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms