Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP3Q9H6T3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPAP3Q9H6T3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPAP3Q9H6T3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP3Q9H6T3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms