Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMOC1Q9H4F8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMOC1Q9H4F8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMOC1Q9H4F8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms