Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX25Q9H3E2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX25Q9H3E2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX25Q9H3E2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX25Q9H3E2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms