Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RSPH6AQ9H0K4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
RSPH6AQ9H0K4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RSPH6AQ9H0K4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
RSPH6AQ9H0K4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms