Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZNF541Q9H0D2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF541Q9H0D2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF541Q9H0D2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF541Q9H0D2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms