Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC22A4Q9H015 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A4Q9H015 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms