Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC2Q9C0B9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZCCHC2Q9C0B9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZCCHC2Q9C0B9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms