Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BARHL1Q9BZE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BARHL1Q9BZE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BARHL1Q9BZE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BARHL1Q9BZE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms