Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SELENOOQ9BVL4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SELENOOQ9BVL4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SELENOOQ9BVL4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms