Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF1Q9BQI6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF1Q9BQI6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLF1Q9BQI6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms