Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDF15Q99988 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF15Q99988 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF15Q99988 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF15Q99988 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms