Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC5LQ99459 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDC5LQ99459 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDC5LQ99459 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDC5LQ99459 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms