Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPAN18Q96SJ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN18Q96SJ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms