Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCNAQ96QF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCNAQ96QF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNAQ96QF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms