Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC85AQ96PX6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC85AQ96PX6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC85AQ96PX6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC85AQ96PX6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC85AQ96PX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms