Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD8Q96LT4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD8Q96LT4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAMD8Q96LT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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