Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC59Q96AG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.76■■■■□ 3
LRRC59Q96AG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRC59Q96AG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRC59Q96AG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms