Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UTP4Q969X6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UTP4Q969X6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTP4Q969X6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms